本篇文章841字,读完约2分钟

经过几个月的验证,他更正了国际共享数据库的错误

(记者陶玉婷)近日,国家生物新闻中心(ncbi)根据苏州发来的邮件,将blast数据库中eu286374.1的样本序列更正为不明物种。ncbi从业者没有想到的是,他们在回复邮件中打电话给的夏博士(编者按)竟然是苏州的一名高三学生。

修改NCBI blast数据库的学生名叫夏添,是苏州工业园区外国语学校的高三学生。去年年底,大二的夏天,我参加了冷泉港亚洲dna学习中心的秋季dna条形码项目,研究虾的进化关系。研究中,在夏季,将一段竹虾的基因测序结果放入ncbi的blast数据库进行比对分析时,没有对虾进行比对,而是找到了序列最接近的鲶鱼,引起了夏季的好奇。

夏天发现这个鲶鱼序列来自于韩国学者的一个数据,但同时也有其他数据表明它是一种细菌。是虾和鲶鱼的序列相似,还是提取样本时细菌感染了样本?如果这确实是细菌,ncbi的数据难道没有错吗?夏天充满了疑惑。在学习中心老师前期研究dna条形码项目时的指导下,到了夏天,带着疑惑,在接下来的几个月里再次研究了基因数据库网站,把韩国学者定居的鲶鱼序列eu266374放到第三方基因数据平台上对比,结果还是细菌。经过几次验证,Summer证实了自己的想法,blast数据库中的这个共享数据真的是错的:这个混有细菌的鲶鱼其实是伪交替单胞菌。

夏天,我立即把这个发现告诉了学习中心的课题导师约翰和王馨悦博士。在老师的鼓励和指导下,我在今年9月的夏天给ncbi写了一封邮件,指出数据库中的样本eu266374与链格孢属有98%的相似性。没想到,邮件发了才五个工作日,夏天就收到了ncbi从业者的回复。基于对夏天的确认,他们决定将样本标记为不明物种,以提醒其他研究人员这个消息的模糊性,这个序列的搜索结果将不再显示在blast数据库中。现在,数据库已经将eu286374.1的样本序列标记为未识别样本。

太神奇了,我也没想到他们会叫我夏博士,大致来说,对方也没想到邮件是高三学生写的。夏天说。

标题:[本地]高三学生被老外称为“夏博士”

地址:http://www.slqncy.com/szxw/26013.html